Как правильно: "подготовка и управление работами" или "подготовка и управление работ" и почему?

Верно: _подготовка работ и управление ими_. Слова _подготовка_ и _управление_ требуют разных падежей, поэтому слово _работа_ не может быть их общим второстепенным членом.