Можно ли применить слово "ЦЕРКОВЬ" к храму, к собору, т.е. к зданию, к сооружению ? Или это слово употребляется только как принадлежность к какой-либо конфессии?

Конечно, можно. У существительного церковь два значения: 'религиозная организация; религия, проповедуемая такой организацией' и 'здание, в котором происходит христианское богослужение'.