Объясните, почему "дебет", но "дебиторская задолженность"?

Дебет - от латинской формы 3-го лица глагола debet (2 спряжение) - буквально "он должен". Здесь -et исторически - личное окончание глагола. 

Слова кредитор и дебитор образованы от другой глагольной основы. Их в латинском три. И иногда глаголы, различающиеся в настоящем времени, совпадают в других временах.