Подскажите, почему слово "отец" в творительном падеже имеет окончание "ом", а "праотец

После ц  в окончаниях и суффиксах под ударением пишется о, без ударения – е. В слове праотец ударение сохраняется на первом слоге во всех формах, в безударном окончании пишется поэтому е.