Подскажите, как правильно "недостаток холодильных агрегатов" или "нехватка холодильных

В значении 'отсутствие кого-, чего-л. в нужном, достаточном количестве' можно употреблять оба слова. Но при этом недостаток – стилистически нейтральное слово, нехватка – разговорное.