Заведующий теоретическим отделом. Или: Заведующий теоретического отдела.
Заведующий теоретическим отделом. Или: Заведующий теоретического отдела.
Лучший ответ:
Корректно: заведующий (чем?) теоретическим отделом.
Ссылка на ответ
Ответ эксперта