Новые сотрудники могут быть не подготовлены к работе в компании. (КАК В ДАННОМ СЛУЧАЕ ПИШЕТСЯ "НЕ" С КРАТКИМ ПРИЛАГАТЕЛЬНЫМ?

Краткое прилагательное пишется с двумя Н: _неподготовленны*_, например: _Новые сотрудники не подготовленны. Новые сотрудники неподготовленны_. Раздельное или слитное написание зависит от смысла, это определяет сам пишущий.
В приведенном примере _не подготовлены_ - краткое причастие, поэтому корректно раздельное написание.