Затраты экономически оправданны и документально подтверждены. Если написано правильно (два н), то в первом случае это краткое прилагательное, а во втором - краткое причастие. Как объяснить, почему это именно так?

Слово _подтвержденный_ не может быть прилагательным, на это указывают и словари. Поэтому единственный вариант краткой формы: _подтверждены_. Что касается слова _оправданны_, то в «Русском орфографическом словаре» указан такой формальный признак разграничения: если форма употреблена с дополнением (в творительном падеже: _оправданы важностью_), то она пишется с одним _н_; если без дополнения (_действия оправданны_) -- с двумя. Возможность образования прилагательных или причастий от глаголов обусловлено морфологическими характеристиками глагола и историческим развитием языка.