По § 194 "Действующих правил правописания" выходит, что "Википедия" нужно писать в кавычках. Названия почтовых марок ("Голубой Маврикий") и станций метро ("Выхино") - тоже в кавычках. Так и есть?

Если речь идет об употреблении этих названий в текстах, то все верно. На картах и схемах названия станций метро не заключают в кавычки. В изолированной позиции (в заголовке веб-страницы, к примеру) название "Википедия" также не закавычивается.